金剛寶座寺的傳承皈依境及佛屬宗派依止四佛陀：阿達爾瑪佛（無形相，以日月二輪為表徵），報身佛多杰羌佛及其在娑婆世界二次真身降世：維摩詰聖尊及南無第三世多杰羌佛。南無第三世多杰羌佛傳承中的十大護法爲獅子金剛，時輪金剛，獨髮母金剛，普巴金剛，大威德金剛，上樂金剛，馬頭金剛，瑪哈嘎拉金剛，閻羅金剛和密跡金剛。